UPCH - R101

Gabriel Carrasco

01/09/2022

Pre-requisitos

A continuación se presentarÔn los pasos necesarios para instalar correctamente R y RStudio en Windows y macOS:

  1. Descargar e Instalar R.
  2. Descargar e instalar RStudio.
  3. Descargar e instalar los paquetes que se utilizarƔn durante el curso.

Requiere de una laptop donde instalar los programas y de una conexión a internet estable durante el proceso de descarga e instalación.

Para el curso deberĆ” tener instalados los siguientes programas:

Los siguientes detalles son tomados de Riva Quiroga.

1. Instalar R

Puedes descargar R desde https://cran.r-project.org/. Debes elegir la opción que corresponda, según tu sistema operativo.

Si utilizas Windows, te preguntarĆ” quĆ© es lo que quieres instalar. Selecciona ā€œbaseā€.

En el caso de macOS, elige la primera opción que aparece bajo ā€œLatest releaseā€, es decir, ā€œR-4.1.2.pkg (notarized and signed)ā€.

Luego, sigue los pasos de instalación, tal como lo haces con cualquier programa.

Si todo sale bien, al abrir R en tu computador deberĆ­as ver algo parecido a esto en Windows y macOS:

La información sobre la versión de R y sobre el sistema operativo que aparece en ese mensaje inicial dependerÔ de la versión descargaste.

2. Instalar RStudio

Una vez que R ha sido correctamente instalado, descarga RStudio desde el siguiente enlace https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/. Elige la primera opción: ā€œRStudio Desktop Open Source Licenseā€ (gratuita).

Instala RStudio en tu computador, tal como lo haces con cualquier programa. Para comprobar que RStudio estĆ” bien instalado, deberĆ­as ver algo parecido a esto (algunas cosas pueden variar segĆŗn tu sistema operativo):

A lo largo del curso trabajaremos con la versión de R y RStudio mÔs actualizada, así que si tienes instalada una versión previa, puede que algunas cosas se vean un poco distintas. Versiones de R anteriores a la 3.5 harÔn que algunas cosas no funcionen, por lo que te sugerimos actualizar.

IMPORTANTE: Si te encuentras con algún error durante este proceso, lo mÔs probabable es que sea por alguna configuración de tu sistema operativo. En ese caso, la mejor manera de buscar una solución es copiar el error que arroja R, pegarlo en tu motor de búsqueda favorito (como Google) y ver cómo alguien que se enfrentó a eso antes lo resolvió. Si por alguna razón no logras resolver los problemas de instalación antes de la primera clase, no te preocupes. Durante esa sesión utilizaremos la versión en la nube de RStudio. A continuación explicaremos cómo registrarse.

Para mÔs detalles sobre la configuración de RStudio ver tutorial de Shannon Pileggi

Importante: RStudio es una interfaz a R, es decir, necesita que Rse encuentre instalado en el equipo para poder usarse. En este curso toda nuestra interacción con R serÔ a través de RStudio. No es necesario abrir ambos programas, solo abrir RStudio y continuar con la instalación.

3. Instalar Paquetes

AdemƔs de instalar R y RStudio deberƔ instalar paquetes con funcionalidades adicionales.

Los paquetes necesarios para este curso son:

Tabla 1: Paquetes de R requeridos
binom GGally leaps Publish
broom ggfortify lsr ResourceSelection
BSDA gghighlight mapview rstatix
caret ggmosaic MASS separationplot
codebook ggsci MatchIt sf
coin ggspatial mlbench sfsmisc
DescTools heatmapFit modelr skimr
doBy janitor moments survival
faraway jtools pracma tidyverse
GADMTools leaflet.extras2 pubh yardstick

Instalación automÔtica

Para instalar todos los paquetes necesarios para el curso, copiar el siguiente código en la consola y dar ENTER.

source("https://raw.githubusercontent.com/healthinnovation/upch_r101/main/r101_init.R")

Es posible que aparezca el siguiente mensaje al momento de la instalación. Escribir ā€œYesā€ en la consola para autorizar la instalación de algunas dependencias.

Verifique que los paquetes en la Tabla 1: Paquetes de R requeridos se han instalado correctamente en la parte inferior derecha de RStudio, pestaƱa ā€œPackagesā€.

Instalación manual

De lo contrario se puede realizar la instalación de los paquetes de forma manual siguiento estos pasos:

1. Ingrese al programa RStudio

Una vez dentro, dirigirse al panel de packages

2. Hacer click en Install

3. Colocar el nombre de los paquetes que se deben instalar

Instalar todos los paquetes listados en la Tabla 1: Paquetes de R requeridos.

4. Descarga e instalación

La instalación demora menos de 5 minutos y requiere conexión a internet. Es normal que aparezcan algunas ventanas de descarga mientras se instalan los paquetes.

5. Verificación

Si deseas comprobar que los paquetes se han instalado correctamente, puedes encontrar los paquetes instalados en la parte inferior derecha de RStudio, pestaƱa ā€œPackagesā€. Verificar que los paquetes en la Tabla 1: Paquetes de R requeridos se han instalado correctamente.

4. Opcional

Si desea personalizar el entorno de RStudio, siga los siguientes pasos:

Para Windows:

Abra RStudio y vaya a la parte superior y cliquƩe en Tools y en el panel desglosable cliquƩe en Global Options...

Para macOS:

Abre RStudio y al costado de la manzanita, cliquea en RStudio y en las opciones desglosables cliquea en Preferencias....

En ambos sistemas operativos, vaya a la sección de Apariencia y modifique el tema, enfoque, tamaño y tipo de letra, y finalmente el tema de su preferencia. Se recomienda un tema con fondo oscuro para evitar el cansancio de su vista. Finalmente, cliquée en OK para aplicar las modificaciones.

Si deseas que tus paréntesis tengan diferente colores, en la sección de Código, luego vaya a Display y selecciones Rainbowl parentheses.